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轉錄組-ceRNA芯片

產品一 circRNA芯片

篩選差異表達miRNA,差異miRNA靶基因預測。

 

技術特點

  1. circRNA所有探針設計基于國際主流circRNA數據庫信息;
  2. 環狀RNA -特異的反向剪接位點探針設計,保證每個探針檢測的特異性,避免與母基因之間的冗余影響。

 

芯片介紹


 

 

產品二 ceRNA芯片

一箭三雕,一張芯片同時檢測lncRNA、circRNA、mRNA。

 

技術特點

  1. 穩定:芯片采用Agilent eArray平臺設計,使用Agilent SurePrint技術合成,探針長60mer,檢出率高,技術重復性高于99%;利用芯片堿基互補雜交的方式,能夠比測序技術更靈敏、穩定地對表達豐度較低的circRNA、lncRNA進行檢測;
  2. 超值:芯片覆蓋circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片數據同時提供三個層面的表達信息,circRNA和lncRNA作為典型的內源競爭性RNA,此款芯片可以讓您暢游ceRNA調控研究;
  3. 特異性高:環狀RNA -特異的反向剪接位點探針設計,保證每個探針檢測的特異性,避免與母基因之間的冗余影響。

 

芯片介紹


 

伯豪特色

  1. 成熟的服務平臺:穩定而系統的芯片實驗全面解決方案,可為客戶提供總RNA抽提、樣品質檢、RNA標記、雜交、洗脫、圖像掃描、數據分析。
  2. 多樣化的服務內容:提供芯片和測序兩種高通量檢測技術以及低通量檢測技術RT-PCR。
  3. 專業的實驗人員:從RNA抽提到芯片雜交均配有專業的實驗人員,豐富的芯片操作經驗,確保芯片實驗順利完成。
  4. 專業的分析團隊:實戰經驗豐富的分析團隊,除能快速完成基礎分析外,還能根據客戶需求完成個性化分析,提供各類高大上的圖表。

 

ceRNA芯片分析流程

 

ceRNA芯片技術參數

 

案例展示

案例一

放射治療是肝癌治療的有效手段之一,然而放射性肝纖維化是肝癌放射治療的常見并發癥,制約肝癌放療效果。放射性肝纖維化的發病機制仍未明晰,有待進一步研究。環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類廣泛參與多種生物學進程的非編碼RNA,在人類多種疾病的發生和發展中發揮重要作用。本研究通過伯豪生物提供的circRNA芯片對正常和接受放療的肝星狀細胞中差異表達的circRNA進行分析,探討其在放射性肝纖維化發病過程中的作用,并通過生物信息學分析,挖掘出這些差異表達基因的潛在功能和與miRNA的互作網絡,為放射性肝纖維化的研究提供新的思路。

 

參考文獻

[1] Chen Y, Yuan B, Wu Z, Dong Y, Zhang L, Zeng Z(2017).Microarray profiling of circular RNAs and the potential regulatory role of hsa_circ_0071410 in the activated human hepatic stellate cell induced by irradiation.Gene,2017,629:35-42.

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