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轉錄組-基于Luminex 200系統的QGP核酸多重檢測

基于Luminex 200系統的QGP核酸多重檢測介紹

QuantiGene® 2.0 高通量核酸定量研究系列產品是世界知名基因芯片制造商Affymetrix 公司旗下Panomics的暢銷產品。QuantiGene® Plex除了利用xMAP技術外,還整合了西門子授權并經過臨床驗證的branched DNA(bDNA)技術,該技術可用于Versant HIV、HBV以及HCV的病毒載量分析,通過信號放大技術,而非模板放大,bDNA技術實現了對模板的直接定量檢測。
QuantiGene® Plex是驗證表達譜芯片和二代測序數據、DNA拷貝數檢測、臨床FFPE樣本和血液樣本的多基因檢測、信號傳導通路檢測以及轉化研究中生物標志物與藥物靶點驗證研究等的理想工具。

 

技術特點

  1. 多重定量:96孔板,80個樣本/板,單孔同時定量檢測多達80個目標基因;當樣本數與基因數較多時,性價比高于定量PCR;
  2. 可測定不同類型的樣本:培養細胞、血液或組織(新鮮、冰凍或福爾馬林固定、石蠟包埋 FFPE等);
  3. 無需抽提純化RNA或DNA,僅需少量固體或液體樣本;
  4. 無需反轉錄RNA;
  5. 無需PCR擴增,避免引入誤差;
  6. 簡化的工作流程。

 

實驗流程

 

服務推薦

  1. 單基因表達定量服務:Affymetrix-Panomics QuantiGene® 2.0 Assay
  2. 多重基因表達定量服務:Affymetrix-Panomics QuantiGene® Plex 2.0 Assay
  3. DNA拷貝數測定服務:Affymetrix-Panomics QuantiGene® Plex DNA Assay
    預設計探針組:Affymetrix已經開發了龐大的已驗證基因的探針庫,超過1600種探針組,包括超過15000個基因。預設計探針組覆蓋了廣泛的物種,包括:人類、小鼠、大鼠、犬類、猴、豬、大豆和玉米等諸多物種,任何現有基因的組合都可以整合設計新的探針組,要了解更全面探針組和基因信息,可訪問www.panomics.com或者聯系我們。
    定制探針組:Affymetrix可針對任何基因以及任何物種提供定制探針服務。定制分析組合為3-80 plex(RNA)和3-33 plex(DNA)。客戶只需提供基因列表、參考序列ID或者DNA序列,即可在兩周內完成設計。

 

儀器平臺

  • Luminex 200液相芯片分析系統

 

案例分析

mRNA靶標驗證

使用Affymetrix GeneChip® Arrays對炎癥通路激活的特征基因表達進行鑒定。繼而通過使用QuantiGene Plex(QGP)和qPCR分析對經LPS處理的小鼠樣本進行測試以進一步驗證該特征。收集52只處理后和未處理的小鼠脾臟,制備組織裂解物進行QGP分析,或同時純化RNA進行qPCR測試。處理后,QGP和qPCR分析均顯示出類似的上調或下調模式。但是相比于qPCR,QGP分析可提供更準確和精密的結果。在本研究中,必須處理14塊qPCR反應板才能獲得一塊QGP反應板相當的信息。

原文:Ebsworth K. Gene expression analysis by Quantigene Plex: validation and applications. Planet xMAP USA; 2007 March 12-14; Laguna Hills, CA


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