技術服務熱線:800-820-5086 | 400-880-5086 登錄 | 注冊 ENGLISH

轉錄組-基于Fluidigm BioMark系統的基因表達分析

基于Fluidigm BioMark系統的基因表達分析介紹

Fluidigm高通量基因分析系統(BioMark?),是集成了流體通路(Integrated Fluidic Circuit,IFC)技術、實時定量PCR技術及強大的基因分析軟件的技術平臺。IFC 將微流控通道、閥門和反應倉集成在一張芯片上,通過一個控制系統自動完成多達9216個PCR反應。集成流體通路技術極大地簡化了生物樣品和試劑的分液操作,提高分析通量和靈敏度,其納升級的反應體系為高通量的基因分析應用節省大量成本、試劑用量和樣品需求量。

 

技術原理

Fluidigm 基因表達分析的原理跟常規熒光定量PCR一致,可以分為Taqman和EvaGreen染料兩種方法,它的特點是反應通量較高、納升級反應體系的成本較低等。

 

芯片規格類型

Biomark? HD系統配套的檢測芯片有如下幾種格式,滿足不同基因和樣本數的研究需求,分別為12*12(12樣本*12基因),48*48(48樣本*48基因),96*96(96樣本*96基因),192*24(192樣本*24基因)。

 

服務流程

方案設計——合同簽訂與送樣——樣本抽提質檢——探針引物預實驗——將樣本和探針引物試劑加到芯片上——將芯片置于Juno系統中,自動進行分液、混合——在Biomark HD上進行實時熒光定量PCR——軟件分析數據

 

樣本要求

  1. 總量:2.5pg-250ng;
  2. RIN>=8.0,28s/18s>=0.7;
  3. OD260/280=1.7-2.1,OD260/230=2.0-2.2;
  4. 無真核或原核生物污染,無DNA或蛋白污染。

 

儀器平臺

  • Fluidigm® BioMark? HD + Juno高通量基因分析系統

 

參考文獻

[1] Li et al. A sequential EMT-MET mechanism drives the differentiation of human embryonic stem cells towards hepatocytes. Nat Commun. 2017 May 3; 8:15166.
[2] Li et al. Generation and Application of Mouse-Rat Allodiploid Embryonic Stem Cells.
Cell. 2016 Jan 14;164(1-2):279-92.
[3] Peng et al. Spatial Transcriptome for the Molecular Annotation of Lineage Fates and Cell Identity in Mid-gastrula Mouse Embryo. Developmental Cell. 2016 Mar 21;36(6):681-97.
[4] Zhang et al. Endocardium Minimally Contributes to Coronary Endothelium in the Embryonic Ventricular Free Walls. Circ Res. 2016 Jun 10;118(12):1880-93.
[5] Hu et al. Direct Conversion of Normal and Alzheimer’s Disease Human Fibroblasts into Neuronal Cells by Small Molecules. Cell Stem Cell. 2015 Aug 6;17(2):204-12.


相扑君的逆袭电子游戏