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轉錄組-PCR Array

RT2 Profiler PCR Array芯片介紹

PCR array是信號通路基礎生物學研究和臨床疾病研究的重要工具。這種功能分類芯片運用成熟的SYBR Green熒光定量PCR技術,專注于一個信號通路中基因的表達水平檢測。與傳統的高密度表達譜芯片相比,PCR array具有針對性強、靈敏度高、準確可靠等優點。陣列選擇覆蓋癌癥、凋亡、信號轉導、細胞因子、炎癥反應、細胞毒理、藥物代謝、干細胞及發育生物學、神經科學等方面。

美國SABioscience公司是Qiagen旗下子公司,目前,SABioscience公司針對不同的信號通路和疾病相關基因設計了150多款功能分類芯片,種屬包括人、小鼠、大鼠、果蠅、豬、兔、雞等,格式分為96孔和4 x 96孔兩種,針對客戶的需求,還有個性化定制芯片服務。上海伯豪生物技術有限公司是Qiagen公司的合作伙伴,能為您提供完善的功能分類基因芯片技術服務,您只需提供保存完好的樣品,我們就可為您完成實驗操作和數據分析。

一個典型的96孔功能分類基因芯片,一般包含84個目的待測基因,以及5個管家基因(HK),1個基因組DNA對照(GDC),3個反轉錄對照(RTC)和3個PCR陽性對照(PPC)。

 

技術優勢

 

  1. 結果高度敏感性,精確性,可復制性:
    1)科學和完整的參照系統:
    對每個樣本都設立了5個housekeeping gene (HKG)、genomic DNA contamination參照 、逆轉錄效率參照(RTC)、陽性PCR 反應條件參照(positive PCR control),確保了每一步實驗的精確性符合發表q-PCR數據的國際標準MIQE。
    2)嚴格的質控過程:
    PCR Array三個步驟涉及的試劑,引物實驗條件均經實驗驗證,確保均一和高度擴增效率,特異性(單峰分離曲線),敏感性(1ng/96-well plate)和寬廣的線性范圍(wide dynamic range 108)
  2. 是操作簡單,節約時間的即用型反應系統:
    在幾個小時內一次性檢測84 or 370個基因的表達水平, 所有實驗條件均已設定,經過驗證,無需優化條件。利用在線分析工具可以在15分鐘內處理數千個Ct值,用戶只需經過簡單培訓,在線分析網站:www.SABiosciences.com/pcrarraydataanalysis.php。
  3. 基因選擇具有科學性和時效性,目標在于解決生物學問題:
    PCR Arrays上基因的選擇過程。這些被選中的基因并不僅僅是簡單的包括某個信號通路中的所有基因,所選基因必須對于相應的信號轉導途徑相當重要,并且是在mRNA水平上調控的。研發人員及生物信息學科學家通過閱讀已發表文獻, 從疾病發病,進展,治療, 耐藥性,等多方面入手。研發部門做了大量實驗來證明所選基因的相關性,并獲得了行業廣泛認可。
  4. 產品應用廣泛:
    有大于1000多篇文獻引用了PCR Array數據,其中包括在Science,PNAS等國際知名雜志上發表的文獻。 全球有1000多個實驗室(包括300多個大學)在使用該產品,中國各地機構有北京/上海/武漢中科院, 中山腫瘤醫院等。

 

目錄產品列表(mRNA)

PCR array list_mRNA

 

服務流程

方案設計——合同簽訂與送樣——樣本抽提質檢——反轉錄——PCR上機——數據分析

 

樣本要求

  1. 樣本類型包括mRNA、miRNA和DNA;
  2. 樣本總量大于1μg;
  3. 無降解,無污染。

 

儀器平臺

  • ABI 7900 HT Sequence Detection System
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