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表觀組-安捷倫甲基化捕獲測序

安捷倫甲基化捕獲測序介紹

    SureSelectXT甲基化靶向序列捕獲平臺(Methyl-Seq)是安捷倫公司推出的全面的甲基化發現系統。該平臺為甲基化基因組區域研究提供了具有單堿基分辨率的高度可靠且高效的方法。現有目錄化產品包括人、小鼠和大鼠甲基化測序設計。該產品相比常見的甲基化檢測平臺具有獨到的優勢。

  • 通過檢測單獨的 CpG 可獨具特色地提供比甲基化芯片更多的信息
  • 相比全基因組重亞硫酸鹽測序,可提高通量并降低成本
  • 可發現限制性內切酶及免疫沉淀所不能檢測的甲基化區域

安捷倫甲基化捕獲測序技術參數

  • 人:84 Mb 設計長度(覆蓋 370 萬 CpG位點)
  • 小鼠:109Mb設計長度
  • 大鼠:97Mb設計長度
優勢
  •   84 Mb 設計覆蓋 370 萬 CpG位點
  •  不依賴于甲基化狀態的探針
  •  高靈敏度,分辨率可達到單個堿基
  •  提高通量并降低成本
  •  與現有甲基化方法相比,可降低偏差 (bias)
測序覆蓋類型
  • CpG島
  • GENCODE 啟動子
  • 癌癥、組織特異性 DMR,或以下類型的調控序列
             CpG Islands, shores/shelves(± 4 kb)

             增強子

             Ensemble 調控區域

             DNase I 高敏感位點

安捷倫甲基化捕獲測序實驗流程


 

安捷倫甲基化捕獲測序分析流程


安捷倫甲基化捕獲測序結果展示