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表觀組-甲基化DNA免疫共沉淀

甲基化DNA 免疫共沉淀測序(MeDIP-seq)技術簡介

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即甲基化DNA 免疫共沉淀測序。先用5′-甲基胞嘧啶抗體富集胞嘧啶甲基化的基因組片斷,然后對富集的片段進行高通量測序。該方法檢測范圍覆蓋全基因組,所需測序數據量較少,但不能在單堿基分辨率水平上檢測DNA胞嘧啶甲基化狀態。

 

伯豪特色

  1. 富集實驗穩定,建庫質量高,失敗率極低,每年五萬例左右各種類型樣本文庫構建經驗。
  2. 質控過程全程可溯,實時跟蹤,反饋及時,確保數據真實可靠。
  3. 基礎分析豐富,展示形式可個性化定制。
  4. 高級分析服務:專業的生物信息分析團隊,熟悉各種分析算法和軟件;根據客戶的需求,提供多種個性化的實現方案。

實驗流程


技術路線


測序策略

  • PE150,40M reads  6G數據量

 

樣品需求(基因組DNA)

  1. 樣品純度:OD 260/280值應在1.8~2.0 之間;RNA 應去除干凈。
  2. 樣品濃度:濃度不低于50ng/ul。
  3. 樣品總量:每個樣品總量不少于1.5ug。
  4. 樣品溶劑:溶解在H20或TE (pH 8.0)中。
  5. 樣品運輸: DNA低溫運輸(-20℃);且在運輸過程中請用parafilm將管口密封好,以防出現污染。
數據分析展示