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基因相互作用網絡圖

Demo結果

 

Demo結果解讀

上圖中節點的大小表示的是基因的degree,顏色代表上下調的信息,邊的顏色或者線型代表是相互作用的來源。

 

基因相互作用網絡圖介紹

基因網絡是一組基因的集合體,這些基因通過相互協作來控制生物體重要的生命過程。我們將客戶關注基因進行基于實驗驗證,其他親緣物種數據庫檢索、文獻挖掘等多種信息進行基因互作網絡的構建,找到關鍵核心基因。

 

分析要求

客戶關注的mRNA(如差異基因)。

 

提供結果

  1. 圖片文件(Network圖),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打開進行細節調整;
  3. 文本文件:基因之間的互作關系,關鍵調節基因的排序(如betweenness centrality)。
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