共表達網絡圖(Coexpression Network
Demo結果
Demo結果解讀
網絡圖為篩選出的核心基因之間的關系,通過圖論的方法計算出關鍵基因,并通過關鍵基因的共表達基因預測出其功能。
共表達網絡構建(Coexpression Network)
根據基因表達信號值的動態變化,計算基因間的共表達關系,得到基因間的表達調控關系及調控方向,從而構建基因的表達調控網絡。利用共表達網絡圖,研究者可通過分析基因調控能力,獲得樣本隨實驗變化的核心調控基因。
分析要求
每組數據3個或3個以上生物學重復并且為差異基因或者關注的部分基因。
提供結果
- 圖片文件(Network圖),包括png,PDF格式;
- Cytocape文件:可以cytoscape打開進行細節調整;
- 文本文件:基因之間共表達相關性以及顯著性,基因核心共表達的排序。