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-lncRNA和mRNA共表達分析

Demo結果

 

Demo結果解讀

網絡圖為篩選出的核心基因之間的關系,通過圖論的方法計算出關鍵lncRNA與mRNA,并通過關鍵lncRNA的共表達mRNA預測出其功能。

 

lncRNA和mRNA共表達分析介紹

共表達網絡圖(Coexpression Network)是根據基因表達信號值的動態變化,計算基因間的共表達關系,得到基因間的表達調控關系及調控方向,從而構建基因的表達調控網絡。通過研究lncRNA與mRNA的共表達關系,研究者可通過分析lncRNA調控能力,獲得樣本隨實驗變化的核心調控lncRNA。

 

分析要求

每組數據3個或3個以上生物學重復,每個樣本均含有lncRNA與mRNA數據,差異基因或者關注的部分基因。

 

提供結果

  1. 圖片文件(Network圖),包括png,PDF格式;
  2. Cytocape文件:可以cytoscape打開進行細節調整;
  3. 文本文件:基因之間共表達相關性以及顯著性,lncRNA,mRNA核心共表達的排序。
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