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-Canonical pathways analysis

Demo結果

 

Demo結果解讀

從IPA的pathway富集結果中不僅可以看到pathway的富集顯著性,并且可以得到pathway的激活抑制的信息。

 

IPA—Canonical pathways analysis介紹

通過IPA的Ingenuity® Knowledge Base數據庫,進行Fisher精確檢驗得到具有顯著性意義的pathway。運用客戶特定的實驗結果來計算每個pathway的z-score值預測pathway激活或者抑制。

 

分析要求

  1. 差異mRNA或者關注的mRNA基因集;
  2. 物種限于人,大鼠,小鼠;
  3. 每個基因有對應的差異倍數。

 

提供結果

  1. 圖片格式:pathway柱狀圖;
  2. 文本格式:pathway的富集結果。

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