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circRNA測序售前常見問題

1.實驗最低起始量是多少?
   5ug total RNA

2.普通全轉錄組測序是否可以測到circRNA?
可以,但找到的circRNA數量要比專門的circRNA建庫方法少一個數量級

3.外泌體是否可以做circRNA測序?
可以,最低起始量200ng,不做rRNA去除,但找到的circRNA數目只有幾百個。建議1ug以上,可以采取pooling的方式

4.circRNA測序的結果為什么沒有circRNA的全長序列?
因為circRNA測序的原理是靠back-splicing位點的reads去識別circRNA,而環上其它位置的序列跟線性RNA是完全一致的,通過二代測序無法區分

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