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circRNA芯片_售后支持

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1、circRNA定量驗證時,引物設計基于哪段序列?

  由于circRNA特殊的環化結構,且與母基因具有相同的序列信息,在設計RT-qPCR引物時,我們建議將上下游引物設計在反向剪切位點的兩側,且產物應包含反向剪切位點,如此能夠有效檢測circRNA的表達量,避免circRNA母基因的冗余影響。具體詳見附件點擊打開鏈接

2、有哪些數據庫可用于查詢circRNA信息?

有很多在線數據庫可供參考,具體可以分為兩大類:信息查詢數據庫和功能研究數據庫。

1)信息查詢數據庫:circBaseCIRCpedia

2)功能研究數據庫,可進行ceRNA分析,蛋白編碼預測,RNA結合蛋白預測等:circRNADbstarBasedeepBasecirc2TraitscircNetCircular RNA Interactome


3、circRNA有哪些研究方向?

  circRNA研究可分為biomarker研究和分子機制研究兩個不同的方向。

   由于circRNA表達穩定、不易降解 、具有組織特異性、疾病特異性等特點,且血液中有豐富的表達, 因此使得circRNA 成為理想的Biomarker

circRNA分子機制的研究與lncRNA類似, circRNA可作為miRNA的海綿吸附體影響miRNA對其下游靶基因的表達調控;circRNA調控母基因的轉錄等生物學功能。此外,circRNA翻譯成蛋白進而調控細胞功能也是一個新的方向。


4、如何預測circRNA的生物學功能?

    circRNA的研究尚處于初級階段,很多功能還有待于進一步研究,目前對circRNA功能的預測主要有兩種方法:(1)通過對circRNA母基因的功能分析來推測circRNA的功能,該功能預測主要基于circRNA調控母基因的原則;(2)通過ceRNA機制分析找到潛在的circRNA-miRNA-mRNA調控網絡,以mRNA的功能推測circRNA的潛在生物學功能,該功能預測基于ceRNA機制。




  

 

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