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表達譜芯片_售后支持

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1、芯片結果都需要RT-qPCR定量驗證么?定量驗證需要注意哪些事項?

  芯片檢測是一種高通量的篩選工具,后期需要進行一系列的驗證工作,其中RT-qPCR是最常見也是最簡便的芯片結果驗證方法。通常在拿到芯片結果后,可以按照鏈接中的方法用RT-qPCR對芯片結果進行驗證點擊打開鏈接

2、如何判斷芯片結果的好壞?

主要從兩個方面來考慮:

一、圖象:

       主要看芯片掃描圖有無劃痕,有無圖象缺失,圖象是否清晰,背景是否過高,點是否規則,大小是否均一,有無融點,拖尾等  現象,圖象均一性如何,是否存在邊緣不清晰,陽性及陰性內參的情況等。

二、數據:

1)檢出率是否異常;(2)相關系數(重復性如何);(3)變異系數(CV值大小);(4)與qPCR趨勢的吻合程度;(5)技術重復中差異基 因的重復程度等。


3、芯片結果里面CV值多大合適?

CV值是標準偏差與平均值之比,用百分數表示,計算公式為:CV = SD/Mean×100%。通過比較兩組數據之間的CV值來判斷芯片體系是否穩定。在Agilent表達譜芯片實驗中,用重復探針點(10次重復)信號的CV值來計算芯片的穩定性和技術的穩定性,不同的芯片這樣的探針點從20100個不等。Agilent商品化芯片的CV值合格閾值是低于15%


4、芯片檢出率大小有沒有什么標準,多大合適?

   芯片檢出率沒有也不應該有一個統一的標準,因為芯片只是一個檢測工具,芯片實驗的結果是以數據的形式反映出樣本里基因表達的情況,也就是說檢出率是樣品本身的屬性,而不是評價芯片實驗質量的指標。即使對于同一個物種,不同材料檢出率也不同,比如,人組織的檢出率要明顯高于細胞。一般來說相同樣品的檢出率相差不超過±5%




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